“HiSeq 測序系統(tǒng)既有Illumina和Solexa在邊合成邊測序上的優(yōu)勢,又融合了新的光學和系統(tǒng)設(shè)計。這些創(chuàng)新重新定義了測序的軌跡,將人類基因組的測序費用降至1萬美元以下。”
HiSeq1000與Hiseq2000測序系統(tǒng)的相同之處在于兩者都采用相同的儀器外觀、工作原理、操作流程及數(shù)據(jù)處理系統(tǒng);不同之處在于HiSeq1000配有1張flowcell,單次運行能產(chǎn)生300G的數(shù)據(jù)量,HiSeq2000配有2張flowcell,單次運行能產(chǎn)生600G的數(shù)據(jù)量。
HiSeq 2000 HiSeq 1000 產(chǎn)量 (2 × 100 bp) 600 Gb 300 Gb 運行時間 ~11 days ~8.5 days 簇生成 cBot cBot 末端配對讀取 6 Billion 3 Billion 單個讀取 3 Billion 1.5 Billion 讀長 2 × 100 bp 2 × 100 bp 質(zhì)量值 > 85% (2 x 50 bp)
(2 × 100 bp)
> 80% (2 x 100 bp)
Hiseq2000 新一代高通量測序系統(tǒng)特點
1、前所未有的產(chǎn)量——HiSeq 2000能夠在單次運行中產(chǎn)生600 Gb的數(shù)據(jù),每天產(chǎn)生55 Gb。該系統(tǒng)使用兩個流動槽和一種新穎的雙表面成像方法,能夠使測序通量及實驗靈活性提升到新的水平。
2、突破性的用戶體驗——HiSeq 2000具有簡化和直觀的單個操作員流程,啟動運行僅需10分鐘的手工操作時間。即插即用試劑,觸摸屏界面,以及實時的運程運行監(jiān)控,讓儀器操作更簡單。文庫制備時96個樣品的平行處理顯著降低了手工操作時間和整體的費用。
3、無可比擬的經(jīng)濟操作——研究人員以30倍的覆蓋度對兩個人類基因組進行測序,每個基因組的費用不到1萬美元。HiSeq 2000能以單個或兩個流動槽的模式運行,并同時運行需要不同讀長的應(yīng)用。
應(yīng)用
HiSeq2000強大的功能和超低的試劑成本可帶領(lǐng)研究人員達到任何測序目標。包括
1、De Novo重頭測序
2、DNA重測序
3、RNA測序:表達譜、轉(zhuǎn)錄組測序等
4、MicroRNA發(fā)現(xiàn)及分析
5、甲基化測序
6、DNA-蛋白互作研究:ChIP-Seq
7、目的區(qū)域捕獲
8、外顯子測序