NIS-Elements 是由尼康開發(fā)而成的一種一體化成像軟件平臺,它可對顯微鏡圖像拍攝以及文檔數(shù)據(jù)管理實現(xiàn)控制。NIS-Elements可處理多維成像任務(wù),同時支持六維圖像的捕獲、顯示、周邊設(shè)備控制以及數(shù)據(jù)管理和分析。
NIS-Elements成像軟件產(chǎn)品系列包括三種各不相同的軟件包,您可以根據(jù)您的用途或應(yīng)用選擇合適的軟件包。
NIS-Elements D 使用基本測量和功能支持生物研究、和工業(yè)應(yīng)用中的彩色文檔管理需求。
NIS-Elements BR 適合進行標(biāo)準(zhǔn)研究應(yīng)用。它具有通過4D(可以從X、Y、Z、時間、波長、位點等六個維度中多選擇4個維度)圖像獲取和設(shè)備的控制功能。
NIS-Elements AR 針對研究應(yīng)用進行優(yōu)化,它具有通過6D(X、Y、Z、時間、波長、位點)圖像獲取和分析全自動獲取和設(shè)備控制的功能。
強大的功能
一:硬件控制:
可以控制尼康電動顯微鏡的電動部件,實現(xiàn)操作鼠標(biāo)化(當(dāng)然鼠標(biāo)的控制功能也可以解除)。CCD的圖像捕獲任務(wù)與電動部件的匹配。除此之外,第三方的電動部件如電動調(diào)焦機構(gòu)、掃描頭、濾光片轉(zhuǎn)輪以及CCD相機也可以控制(有的硬件需另外增加插件模塊)。
二:多維圖像的捕獲、存檔、顯示:
1. 三維圖像:Z軸XY掃描(XY+Z)、記錄(XY+T)、多色熒光(XY+波長)都是三維圖像捕獲的典型例子,這些功能對于NIS-Elements軟件來說只是很容易實現(xiàn)的功能。
2. NIS-Elements軟件可以將這六維參量同時測量并捕獲圖像。并具以ND2文檔格式將六維捕獲圖像保存在一個文件中。
3.多維圖像的顯示:NIS-Elements可以將六維圖像分解成各個維度進行顯示。
4.多點捕獲的圖像還可以完成無縫隙拼接。
三:圖像處理、分割、測量、分析:
NIS-Elements提供了一個LUT,無論是實時圖像顯示還是從外存貯器讀出的圖像文檔,LUT都可以進行RGB或都灰度、對比度等參數(shù)進行調(diào)節(jié),從而使圖像銳度、色調(diào)、對比度均處于狀態(tài),便于我們進行圖像的識別分割,以進行進一步的測量和分析。
圖像分割:可進行灰度分割和彩色分割??梢宰詣臃指睿部梢允謩狱c取目標(biāo)(手動點取目標(biāo)時,NIS同樣賦于智能目標(biāo)邊界識別功能)。
測量:NIS提供了手動交互測量和自測量兩種方式,可以將目標(biāo)的形態(tài)參數(shù)以及光密度參數(shù)測量(當(dāng)然需要預(yù)選定標(biāo))。
分析:測量所得數(shù)據(jù)可以進行篩選和分類分析,數(shù)據(jù)可以輸出到電子表格中,也可以繪制成各種圖表(直方圖、餅圖等)。
四:生成:
Report Generator(生成器)允許用戶定制圖文,其中包含圖像、數(shù)據(jù)庫參數(shù)、測量數(shù)據(jù)、用戶輸入文本、圖表等。
NIS能夠?qū)⑽募敵龅絇DF文檔格式。
五:圖形數(shù)據(jù)庫管理功能(插件):
NIS-Elements具有一個大的圖像數(shù)據(jù)庫模塊,它支持圖像和數(shù)據(jù)元。可以在其中輕松創(chuàng)建各種數(shù)據(jù)庫和表,并且可以通過鼠標(biāo)單擊將圖像保存到數(shù)據(jù)庫。根據(jù)給每個圖像分配的數(shù)據(jù)庫字段還可以篩選、排序和多次分組。
六: 新型設(shè)計
1:多層文檔結(jié)構(gòu):
每一個文件(圖像)都包含一個三層數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(批注信息、二進制信息、色彩信息)。因而適合于分析用。多層結(jié)構(gòu)圖通過JPEG2000/ ND2/LIM文件格式保存。
NIS-Elements軟件可以識別JPEG2000,ND2,TIFF,JFF,JPG,BMP,LIM。ICS、IDS結(jié)構(gòu)的圖形文件。其中ND2允許在ND2圖像實驗中進行圖像排列。同時包含了硬件設(shè)置信息。
2:圖像管理布局器:
圖像管理器布局方便于圖像文件和數(shù)據(jù)庫的處理。此外,它還有許多方便的特性。點擊NIS-Elements窗口中右上角的Organizer Layout按鍵或者按下F10將啟動Organizer Layout。
整個窗口主要由兩個相同的面板組成。每一個面板可以變換兩種模式:文件模式和數(shù)據(jù)庫模式。從視圖菜單中點擊"Next Pane"可以在兩塊面板中進行切換。要從其中一塊面板中向另一塊面板中復(fù)制文件直接將選中文件拖至另一面板即可。
3:功能插件模塊
圖像數(shù)據(jù)庫管理模塊:
NIS-Elements有一個大的內(nèi)部數(shù)據(jù)庫管理軟件。數(shù)據(jù)庫支持圖像和元數(shù)據(jù),允許用戶生成模板或直接打印和PDF化??梢苑奖愕亟?shù)據(jù)和編輯表。
此外,濾鏡、排序和多重分組都可以通過圖形用戶界面的拖放功能實現(xiàn)。
EDF景深擴展模塊:
通過電動或手動聚焦,NIS可以獲取Z軸序列圖,并將Z軸序列圖整合成共焦點圖像,生成立體視視覺效果和三維表面效果圖。
用NIS-Elements搭建成的顯微鏡成像系統(tǒng)
(1)基本成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康DS-Fi1/DXM1200c;
顯微鏡:尼康50i/80i/TE2000S/U
軟件:NIS-Elements BR
可以實現(xiàn)的功能:
–1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入圖像;
–2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
–3)自動/手動拼圖
(2)4維成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康DS-Fi1/DXM1200c;
顯微鏡:尼康50i/80i/TE2000S/U
軟件:NIS-Elements BR + 4D Imaging
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入以及4維圖像;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)自動/手動拼圖
– 4)圖文
(3)6維成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康DS-5Mc/DXM1200c;
顯微鏡:尼康90i/TE2000E + Auto Stage
軟件:NIS-Elements AR + 6D Imaging
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入以及4到6維圖像;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)自動/手動拼圖
– 4)圖文
(4)活細(xì)胞成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康DS-2Wc;
顯微鏡:尼康TE2000E
軟件:NIS-Elements BR + Time Measurement
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)熒光動態(tài)測量,Ratio測量;
– 4) 時間間隔拍攝(Timelapse)
– 5)自動/手動拼圖
– 6)圖文
(5)活細(xì)胞成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:Roper Coolsnap HQ2
顯微鏡:尼康TE2000-PFS
軟件:NIS-Elements BR + Time Measurement
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)熒光動態(tài)測量,Ratio測量;
– 4) 時間間隔拍攝(Timelapse)
– 5)長時間拍攝時,避免焦點漂移;
– 6)自動/手動拼圖
– 7)圖文
(6)厚標(biāo)本成像分析系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康 DS-Fi1/DXM1200c
顯微鏡:尼康90i/80i/SMZ
軟件:NIS-Elements BR + EDF
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)實時景深擴展功能,觀察厚標(biāo)本;
– 4)自動/手動拼圖
(7)“數(shù)字共聚焦”系統(tǒng)
構(gòu)成:
相機:尼康 DXM1200c/Roper Coolsnap HQ2
顯微鏡:尼康90i/TE2000E
軟件:NIS-Elements AR + 3D Deconvolution
可以實現(xiàn)的功能:
– 1)拍攝X-Y/X-Y-Z/X-Y-T/X-Y-入;
– 2)形態(tài)學(xué)的全自動測量/半自動測量/交互式測量;
– 3)3D去模糊;
– 4)拼圖